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| Code acte | : | 5271 |
| Désignation | : | SARS-COV-2:DÉTECTION GÉNOME PAR LES TECHNIQUES D'AMPLIFICATION GÉNIQUE |
| SARS-COV-2 : DÉTECTION GÉNOME PAR LES TECHNIQUES
D'AMPLIFICATION GÉNIQUE
Détection du génome du SARS-CoV-2 par les techniques
d'amplification génique réalisée lors du diagnostic
initial et lors du suivi de l'infection par ce virus.
Les indications prises en charge sont celles définies
par le Haut Conseil de la Santé Publique et par les
autorités sanitaires au vu de la situation
épidémiologique.
Pour la détection du génome Sars-CoV-2 par RT-PCR le
prélèvement à privilégier est un prélèvement
nasopharyngé profond des voies respiratoires hautes
par écouvillonnage ou un prélèvement des voies
respiratoires basses (crachats ou liquide
bronchoalvéolaire) ;
o Pour la détection du génome Sars-CoV-2 par
RT-PCR le prélèvement peut également être haut de
type salivaire ou oropharyngé, entendu comme un
prélèvement pharyngé par voie orale en seconde
intention, lorsque le prélèvement nasopharyngé est
difficilement ou pas réalisable ou de type salivaire
en première intention dans le cadre d'un diagnostic
itératif ciblé à large échelle sur population fermée.
o Pour les autres techniques de détection du
génome Sars-CoV-2, le prélèvement est obligatoirement
un prélèvement naso-pharyngé profond des voies
respiratoires hautes par écouvillonnage, à
l'exception de certains dispositifs, dont la liste
est mise en ligne sur le site internet du ministère
chargé de la santé, pour lesquels le prélèvement peut
être de type salivaire ;
o chaque prélèvement doit obligatoirement être
accompagné de renseignements cliniques, en
particulier ceux indiqués sur la fiche de
renseignements du Centre national de référence des
virus des infections respiratoires dont la grippe et
notamment :
o Contexte : contact étroit avec un cas
confirmé... ;
o Statut vaccinal pour la grippe saisonnière ;
o Signes cliniques évocateurs...
Le résultat doit être transmis dans les 24 heures. Le
dispositif médical de diagnostic in vitro utilisé
doit avoir été préalablement validé par le Centre
national de référence des virus des infections
respiratoires (dont la grippe) ou disposer d'un
marquage CE. Dans tous les cas, le test utilisé doit
détecter au moins deux séquences virales et doit être
mentionné dans le compte rendu. En cas de résultats
discordants entre ces deux cibles, un nouvel examen
est à réaliser à partir d'un nouveau prélèvement. La
manipulation des échantillons respiratoires doit se
faire dans un laboratoire LSB2, sous PSM2, quelles
que soient les activités réalisées (mise en tampon de
lyse pour l'extraction des acides nucléiques,
ensemencement à visée bactériologiques, cytologie des
liquides type liquide bronchoalvéolaire...). Le
laboratoire de biologie médicale doit être
préalablement accrédité ou en démarche
d'accréditation et dont la portée inclut les
techniques d'amplification génique. |
| Date création | : | 09/03/2020 |
| Date effet | : | 30/12/2025 |
| Entente préalable | : | NON |
| Bulletin d'information | : | NON |
| Remboursable à 100% | : | NON |
| Nombre maximum de codes | : | Non renseigné |
| Indications médicales | : | OUI |
| Acte réservé ou autorisé | : | OUI |
| Initiative du biologiste | : | NON |
| R.M.O. | : | NON |
| Examen sanguin | : | NON |
Cotations :
Exécutants :
| B : | LABM ACP EXCLUSIF ,
LABM SAUF ACTES ACP (ANATOMO-CYTOPATHOLOGIE) ,
LABM Y COMPRIS ACTES ACP |
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